Die Organisation der Hygieneangelegenheiten setzt sich aus klinikinternen Mitarbeitern im Verbund mit dem Beratungszentrum für Hygiene in Freiburg zusammen (BZH). Das BZH stellt die Hygienefachkraft und den Krankenhaushygieniker und gewährleistet, dass die aktuellen Richtlinien des RKI und der KH-Hygieneverordnung in die hauseigenen Hygienestandards einfließen und eine Hygieneberatung jederzeit möglich ist.
Für eine klare Organisationsstruktur des Hygienemanagements wurden eine Hygienefachkraft, ein Krankenhaushygieniker sowie ein Hygienebeauftragter Arzt benannt. Zusätzlich wurden neben der jährlichen Hygieneschulung der Mitarbeiter ausgewählte Pflegekräfte auf den Stationen spezifisch weitergebildet.